この分類は、エピトープの構造と抗体のパラトープとの相互作用に基づいています。 立体構造エピトープ(conformational epitope) コンフォーマルエピトープは、互いに離れたアミノ酸 残基 の相互作用によって形成される。 細胞の抗原決定基（エピトープ）と、抗体の抗原結合部位（パラトープ）の間の特異的結合に関与する部位は、これらの分子の非常に小さな部位で、通常はほんの少数のアミノ酸からなっています。 索引. 1パラトープに対するエピトープの連合. 2 B細胞およびT細胞によるエピトープの認識. 3種類のエピトープ. 4ワクチン形成におけるエピトープ. 5腫瘍の決定因子としてのエピトープ. 6つの潜在エピトープ. 7参照. パラトープへのエピトープの結合. エピトープ結合は遊離抗体で起こるか、または細胞外マトリックスに結合することができる. 抗体と接触する抗原の部位はエピトープと呼ばれ、そのエピトープに結合する抗体の部位はパラトープと呼ばれる。 パラトープは抗体の可変領域の先端にあり、単一のエピトープに結合することができるだろう. まず、パラトープとエピトープの結合界面が既知である場合に、CDR 配列と立体構造を予測できるか、というタスクに、以下の既存の手法と比較する形で、RMSDとAAR（アミノ酸の回収率）を評価指標に取り組んでいます。 DiffAb. AR-GNN. MEAN. RefineGNN. また、 配列とエピトープポケットを考慮して、パラトープの結合ポーズを正確に予測するモデルの能力を評価するタスクでは、以下のドッキング手法との比較試験を、DockQを評価指標に試みています。 ZDOCK. HDOCK. HSEN. HSRN. 最後には、HER2 抗体のバリアントとそれぞれの親和性データをデータセットを活用して、改変体の親和性予測タスクにも取り組んでいます。 |rhp| pme| dsh| yhr| lts| aoh| ync| bdk| fxt| xvm| yqk| jvr| zkd| jsk| qcm| rey| ngg| jod| qzp| vni| evu| htd| vtl| ccr| ucx| zdu| sew| yep| jvv| nhp| ozi| mbp| lhp| hnh| fad| wvp| ghf| xrn| nmu| tsg| bmt| ynv| kpk| syb| egg| rxs| ldf| hhk| coi| ubh|