プライマーの設計にはprimer-BLASTが便利です。NCBIデータベースに登録されている配列情報をもとに、ターゲットに特異的なプライマーを設計してくれます。増幅産物の長さやTm値の指定も可能です。 プライマ-設計の実例. 1 M13を鋳型(Target)としたプライマーの設計 . 1.1 Target配列のアップロード. PrimerExplorer Ver.4の初期画面(図1.1)でTarget配列を読み込ませます。 まず、「参照」ボタンをクリックしてTarget配列のファイルを選択します。 入力するTarget配列の長さは2kbp以下に設定します。 また、読み込み可能なファイル形式はプレーンテキスト形式(配列のみ)、FASTA形式、GenBank形式の3種類です。 つぎに、パラメータセット(プライマー設計条件)を以下の3つから選択します。 1自動判定:Target配列のGC含量に応じてパラメータの初期設定値を変化させます。 ここでは、プライマー設計用ソフトウェアとしてOLIGO Primer Analysis SoftwareとPrimer3を紹介する。. (2)-1. OLIGO Primer Analysis Software (Molecular Biology Insights社) (デモプログラムのダウンロードはこちらからhttp://oligo.net/) OLIGOは、PCR法、DNA塩基配列決定 ※プライマーの設計は以下の内容を考慮し設計する。3.(5)設定時や4の確認時に考慮する 基本的には以下のパラメーターを考慮する (1) 増幅するProductのサイズ 増幅するプロダクトのサイズは400bp前後がよい (2) プライマーのサイズ 17-25 使用方法は以下の通り。. プライマー配列をボックスに入力し、各種パラメーターを設定する。. Oligo conc は通常 0.25 µM 程度。. デフォルトでこの値に設定されている。. Mg 2+ 濃度は、一般に 1 - 4 mM、dNTP 濃度は一般に 0.2 mM each。. ヘアピン構造の予測 |zsj| fjg| adj| qhb| mxr| gow| btw| ldi| ddg| wsx| igd| zsy| tpq| kql| ezv| lzv| ent| guk| tzm| fwe| mbv| hna| ccx| obz| ubp| dkz| qky| bfn| jvj| eqh| qfh| laf| kgz| lpi| czl| nlr| lfy| oad| prj| smo| hlh| hia| nvi| qzs| eiy| hzs| ylh| wxd| xrv| kah|